Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CLN6Q9NWW5 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CLN6Q9NWW5 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CLN6Q9NWW5 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.39□□□□□ -2.79
CLN6Q9NWW5 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CLN6Q9NWW5 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CLN6Q9NWW5 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CLN6Q9NWW5 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.4□□□□□ -2.79
CLN6Q9NWW5 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLN6Q9NWW5 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLN6Q9NWW5 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CLN6Q9NWW5 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
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CLN6Q9NWW5 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
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CLN6Q9NWW5 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CLN6Q9NWW5 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CLN6Q9NWW5 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
CLN6Q9NWW5 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CLN6Q9NWW5 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CLN6Q9NWW5 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
CLN6Q9NWW5 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CLN6Q9NWW5 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CLN6Q9NWW5 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CLN6Q9NWW5 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CLN6Q9NWW5 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CLN6Q9NWW5 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
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