Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PRRT1Q99946 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
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PRRT1Q99946 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
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PRRT1Q99946 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PRRT1Q99946 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
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PRRT1Q99946 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
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PRRT1Q99946 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.73□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
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PRRT1Q99946 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
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PRRT1Q99946 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PRRT1Q99946 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
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