Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
CAVIN4Q5BKX8 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
CAVIN4Q5BKX8 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CAVIN4Q5BKX8 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CAVIN4Q5BKX8 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CAVIN4Q5BKX8 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CAVIN4Q5BKX8 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CAVIN4Q5BKX8 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CAVIN4Q5BKX8 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
CAVIN4Q5BKX8 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
CAVIN4Q5BKX8 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
CAVIN4Q5BKX8 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
CAVIN4Q5BKX8 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-3.12□□□□□ -2.91
CAVIN4Q5BKX8 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
CAVIN4Q5BKX8 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
CAVIN4Q5BKX8 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
CAVIN4Q5BKX8 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
CAVIN4Q5BKX8 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.6 ms