Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
TRAM1Q15629 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
TRAM1Q15629 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.98□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-3□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-3□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
TRAM1Q15629 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-3.07□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
TRAM1Q15629 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
TRAM1Q15629 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
TRAM1Q15629 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
TRAM1Q15629 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
TRAM1Q15629 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
TRAM1Q15629 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
TRAM1Q15629 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
TRAM1Q15629 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
TRAM1Q15629 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
TRAM1Q15629 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
TRAM1Q15629 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
TRAM1Q15629 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226 ms