Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
CAPRIN1Q14444 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CAPRIN1Q14444 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CAPRIN1Q14444 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.6 ms