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Protein–RNA interactions for Protein: Q13536
C1orf61, Protein CROC-4, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
C1orf61
Q13536
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□□□□□ -2.69
C1orf61
Q13536
RNU6-1111P-201
ENST00000391118
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BASIC
-1.75
□□□□□ -2.69
C1orf61
Q13536
RNU6-630P-201
ENST00000391258
106 nt
BASIC
-1.75
□□□□□ -2.69
C1orf61
Q13536
LEKR1-212
ENST00000640869
237 nt
TSL 5
BASIC
-1.75
□□□□□ -2.69
C1orf61
Q13536
RNU6-608P-201
ENST00000383927
104 nt
BASIC
-1.76
□□□□□ -2.69
C1orf61
Q13536
RNU6-959P-201
ENST00000384671
107 nt
BASIC
-1.76
□□□□□ -2.69
C1orf61
Q13536
MIR548AA1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.69
C1orf61
Q13536
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72 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
RNU6-695P-201
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BASIC
-1.76
□□□□□ -2.69
C1orf61
Q13536
Y_RNA.620-201
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88 nt
BASIC
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□□□□□ -2.69
C1orf61
Q13536
Y_RNA.109-201
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BASIC
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□□□□□ -2.69
C1orf61
Q13536
Y_RNA.325-201
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122 nt
BASIC
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□□□□□ -2.69
C1orf61
Q13536
SNORA19-201
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128 nt
BASIC
-1.77
□□□□□ -2.69
C1orf61
Q13536
RNU6-604P-201
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100 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
MIR3133-201
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BASIC
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C1orf61
Q13536
Y_RNA.103-201
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102 nt
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C1orf61
Q13536
RNU6-194P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.69
C1orf61
Q13536
MIR548V-201
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80 nt
BASIC
-1.78
□□□□□ -2.69
C1orf61
Q13536
MIRLET7A1-201
ENST00000362295
80 nt
BASIC
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□□□□□ -2.7
C1orf61
Q13536
RNA5SP405-201
ENST00000363059
114 nt
BASIC
-1.79
□□□□□ -2.7
C1orf61
Q13536
SNORD45.1-201
ENST00000363181
77 nt
BASIC
-1.79
□□□□□ -2.7
C1orf61
Q13536
Y_RNA.204-201
ENST00000364112
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.7
C1orf61
Q13536
Y_RNA.211-201
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101 nt
BASIC
-1.79
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C1orf61
Q13536
RNY4P7-201
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96 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
RNU6-1056P-201
ENST00000383996
107 nt
BASIC
-1.79
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C1orf61
Q13536
RNU6-209P-201
ENST00000384118
107 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
SNORD116-16-201
ENST00000384533
92 nt
BASIC
-1.79
□□□□□ -2.7
C1orf61
Q13536
RNU6-598P-201
ENST00000364017
105 nt
BASIC
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□□□□□ -2.7
C1orf61
Q13536
Y_RNA.261-201
ENST00000364631
102 nt
BASIC
-1.8
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C1orf61
Q13536
RNU6-497P-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.7
C1orf61
Q13536
RNU6-402P-201
ENST00000410678
103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.7
C1orf61
Q13536
RNU6-589P-201
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107 nt
BASIC
-1.8
□□□□□ -2.7
C1orf61
Q13536
U4.4-201
ENST00000620626
117 nt
BASIC
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□□□□□ -2.7
C1orf61
Q13536
RNU6-1306P-201
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99 nt
BASIC
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□□□□□ -2.7
C1orf61
Q13536
RNU6-841P-201
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107 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
Y_RNA.53-201
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102 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
RNU6-668P-201
ENST00000364180
107 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
RNU6-755P-201
ENST00000364400
103 nt
BASIC
-1.82
□□□□□ -2.7
C1orf61
Q13536
AL031737.1-201
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223 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
RNU6-330P-201
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107 nt
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C1orf61
Q13536
RNU6-219P-201
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C1orf61
Q13536
RNU6-995P-201
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107 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
SNORA40.13-201
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120 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
Y_RNA.699-201
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93 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
MIR3170-201
ENST00000582699
77 nt
BASIC
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□□□□□ -2.7
C1orf61
Q13536
ST7-OT3_1.1-201
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74 nt
BASIC
-1.84
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C1orf61
Q13536
MIR520D-201
ENST00000385002
87 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
TRAJ53-201
ENST00000390485
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APPRIS P1
BASIC
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□□□□□ -2.71
C1orf61
Q13536
RNU6-982P-201
ENST00000516216
102 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
RNU6-1191P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.71
C1orf61
Q13536
CR2-207
ENST00000640301
151 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-1.85
□□□□□ -2.71
C1orf61
Q13536
RNU6-1094P-201
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BASIC
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C1orf61
Q13536
MIR548BB-201
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66 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
RNU6-247P-201
ENST00000362636
107 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
SNORA63.4-201
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BASIC
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C1orf61
Q13536
RNU6-81P-201
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104 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
AC120024.2-201
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175 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
MALAT1.1-201
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95 nt
BASIC
-1.87
□□□□□ -2.71
C1orf61
Q13536
TARS-215
ENST00000626210
201 nt
TSL 5
BASIC
-1.87
□□□□□ -2.71
C1orf61
Q13536
RNU6-315P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.71
C1orf61
Q13536
SNORA27.2-201
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126 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
Y_RNA.321-201
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102 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
RNU6-1034P-201
ENST00000365335
101 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
Y_RNA.709-201
ENST00000516952
92 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
RNY4P18-201
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BASIC
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C1orf61
Q13536
AL365222.1-201
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98 nt
BASIC
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□□□□□ -2.71
C1orf61
Q13536
U2.18-201
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84 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
MIR3123-201
ENST00000583417
75 nt
BASIC
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□□□□□ -2.71
C1orf61
Q13536
SPRY4-IT1_2.1-201
ENST00000612613
121 nt
BASIC
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□□□□□ -2.71
C1orf61
Q13536
AC006160.2-201
ENST00000637708
154 nt
BASIC
-1.9
□□□□□ -2.71
C1orf61
Q13536
SNORD113.1-201
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73 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
RNU6-675P-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.72
C1orf61
Q13536
MIR630-201
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97 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
RNU6-1267P-201
ENST00000410747
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BASIC
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□□□□□ -2.72
C1orf61
Q13536
AP001318.4-201
ENST00000616637
121 nt
BASIC
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□□□□□ -2.72
C1orf61
Q13536
Y_RNA.532-201
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113 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
Y_RNA.607-201
ENST00000410597
98 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
Y_RNA.611-201
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108 nt
BASIC
-1.93
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C1orf61
Q13536
RNU4-88P-201
ENST00000411220
86 nt
BASIC
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□□□□□ -2.72
C1orf61
Q13536
RNU6-1168P-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.72
C1orf61
Q13536
Y_RNA.591-201
ENST00000410228
104 nt
BASIC
-1.94
□□□□□ -2.72
C1orf61
Q13536
TMSB4XP3-201
ENST00000445144
114 nt
BASIC
-1.94
□□□□□ -2.72
C1orf61
Q13536
RNY4-201
ENST00000516507
96 nt
BASIC
-1.94
□□□□□ -2.72
C1orf61
Q13536
MIR548AM-201
ENST00000584298
74 nt
BASIC
-1.94
□□□□□ -2.72
C1orf61
Q13536
SNORD1B-201
ENST00000363091
84 nt
BASIC
-1.95
□□□□□ -2.72
C1orf61
Q13536
MIR3668-201
ENST00000582138
75 nt
BASIC
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□□□□□ -2.72
C1orf61
Q13536
RNU6-1117P-201
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BASIC
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C1orf61
Q13536
RNU6-1081P-201
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107 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
RNU6-230P-201
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BASIC
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C1orf61
Q13536
RNU7-160P-201
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C1orf61
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RNU6-844P-201
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BASIC
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C1orf61
Q13536
SNORD19B.1-201
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80 nt
BASIC
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Q13536
Y_RNA.219-201
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BASIC
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Y_RNA.449-201
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Q13536
RNU6-22P-201
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C1orf61
Q13536
RNU6-267P-201
ENST00000516714
103 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
MIR4484-201
ENST00000582855
83 nt
BASIC
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C1orf61
Q13536
Y_RNA.186-201
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92 nt
BASIC
-2
□□□□□ -2.73
C1orf61
Q13536
SNORA41B-201
ENST00000384785
128 nt
BASIC
-2
□□□□□ -2.73
C1orf61
Q13536
RNU6-258P-201
ENST00000390884
101 nt
BASIC
-2
□□□□□ -2.73
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