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Protein–RNA interactions for Protein: Q12846
STX4, Syntaxin-4, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
STX4
Q12846
MIR630-201
ENST00000384957
97 nt
BASIC
-2.82
□□□□□ -2.86
STX4
Q12846
RNU6-766P-201
ENST00000362478
107 nt
BASIC
-2.83
□□□□□ -2.86
STX4
Q12846
Y_RNA.544-201
ENST00000384650
113 nt
BASIC
-2.83
□□□□□ -2.86
STX4
Q12846
Y_RNA.532-201
ENST00000384590
113 nt
BASIC
-2.84
□□□□□ -2.86
STX4
Q12846
RNU6-258P-201
ENST00000390884
101 nt
BASIC
-2.84
□□□□□ -2.86
STX4
Q12846
Y_RNA.699-201
ENST00000516803
93 nt
BASIC
-2.84
□□□□□ -2.86
STX4
Q12846
RNU6-980P-201
ENST00000516925
103 nt
BASIC
-2.84
□□□□□ -2.86
STX4
Q12846
MIRLET7A1-201
ENST00000362295
80 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
RNU6-247P-201
ENST00000362636
107 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
RNU6-497P-201
ENST00000365316
104 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
RNU6ATAC32P-201
ENST00000516026
76 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
MIR548AM-201
ENST00000584298
74 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
RNA5SP93-201
ENST00000362525
114 nt
BASIC
-2.87
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
Y_RNA.449-201
ENST00000384187
102 nt
BASIC
-2.87
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
MIR2052-201
ENST00000636055
55 nt
BASIC
-2.87
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
RNU6-668P-201
ENST00000364180
107 nt
BASIC
-2.88
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
RNU6-219P-201
ENST00000364728
107 nt
BASIC
-2.88
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
RNU6-1325P-201
ENST00000364905
105 nt
BASIC
-2.88
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
SNORD116-22-201
ENST00000384430
92 nt
BASIC
-2.88
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
RNU6-1034P-201
ENST00000365335
101 nt
BASIC
-2.89
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
SPRY4-IT1_2.1-201
ENST00000612613
121 nt
BASIC
-2.89
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
SNORD1B-201
ENST00000363091
84 nt
BASIC
-2.9
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
SNORA41B-201
ENST00000384785
128 nt
BASIC
-2.9
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
MIR548BB-201
ENST00000626714
66 nt
BASIC
-2.9
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
MIR1297-201
ENST00000637311
77 nt
BASIC
-2.9
□□□□□ -2.87
STX4
Q12846
Y_RNA.204-201
ENST00000364112
102 nt
BASIC
-2.91
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
RNA5SP173-201
ENST00000364857
136 nt
BASIC
-2.91
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
RNU6-1081P-201
ENST00000384537
107 nt
BASIC
-2.91
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
RNU6-129P-201
ENST00000391022
107 nt
BASIC
-2.91
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
MIR8053-201
ENST00000613344
75 nt
BASIC
-2.91
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
CR2-207
ENST00000640301
151 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-2.92
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
SNORD113.1-201
ENST00000363280
73 nt
BASIC
-2.93
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
SNORA27.2-201
ENST00000363365
126 nt
BASIC
-2.93
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
TRAJ53-201
ENST00000390485
66 nt
APPRIS P1
BASIC
-2.93
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
RNU6-995P-201
ENST00000391244
107 nt
BASIC
-2.93
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
MTRNR2L9-201
ENST00000622562
75 nt
BASIC
-2.93
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
LEKR1-212
ENST00000640869
237 nt
TSL 5
BASIC
-2.93
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
Y_RNA.53-201
ENST00000362765
102 nt
BASIC
-2.94
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
Y_RNA.219-201
ENST00000364232
113 nt
BASIC
-2.94
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
Y_RNA.261-201
ENST00000364631
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
RNU6-402P-201
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103 nt
BASIC
-2.94
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
RNU6-267P-201
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103 nt
BASIC
-2.94
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
MIR4484-201
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83 nt
BASIC
-2.94
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
RNY4P18-201
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89 nt
BASIC
-2.95
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
RNU7-151P-201
ENST00000516930
53 nt
BASIC
-2.96
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
MIR3139-201
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76 nt
BASIC
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□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
Y_RNA.421-201
ENST00000384052
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BASIC
-2.97
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
RNU6-589P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
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111 nt
BASIC
-2.97
□□□□□ -2.88
STX4
Q12846
Y_RNA.284-201
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BASIC
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STX4
Q12846
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BASIC
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□□□□□ -2.89
STX4
Q12846
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64 nt
BASIC
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STX4
Q12846
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BASIC
-2.99
□□□□□ -2.89
STX4
Q12846
SNORD19B.1-201
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80 nt
BASIC
-2.99
□□□□□ -2.89
STX4
Q12846
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ENST00000411940
142 nt
TSL 5
BASIC
-3
□□□□□ -2.89
STX4
Q12846
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301 nt
TSL 3
BASIC
-3
□□□□□ -2.89
STX4
Q12846
RNU6-380P-201
ENST00000410207
107 nt
BASIC
-3.01
□□□□□ -2.89
STX4
Q12846
Y_RNA.611-201
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108 nt
BASIC
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□□□□□ -2.89
STX4
Q12846
MALAT1.1-201
ENST00000618249
95 nt
BASIC
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□□□□□ -2.89
STX4
Q12846
SNORA63.4-201
ENST00000362763
126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.89
STX4
Q12846
SNORD45A-201
ENST00000384512
84 nt
BASIC
-3.02
□□□□□ -2.89
STX4
Q12846
RNU4-88P-201
ENST00000411220
86 nt
BASIC
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STX4
Q12846
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139 nt
BASIC
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STX4
Q12846
MIR7978-201
ENST00000636158
59 nt
BASIC
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STX4
Q12846
RNU6-755P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.89
STX4
Q12846
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BASIC
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STX4
Q12846
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BASIC
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□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
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88 nt
BASIC
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□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
RNU6-172P-201
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93 nt
BASIC
-3.05
□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
RNA5SP405-201
ENST00000363059
114 nt
BASIC
-3.06
□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
MT-TM-201
ENST00000387377
68 nt
BASIC
-3.06
□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
AL031737.1-201
ENST00000450125
223 nt
BASIC
-3.06
□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
RNU6-523P-201
ENST00000516304
54 nt
BASIC
-3.06
□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
U6.97-201
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101 nt
BASIC
-3.06
□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
RNY4-201
ENST00000516507
96 nt
BASIC
-3.07
□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
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121 nt
BASIC
-3.07
□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
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ENST00000637708
154 nt
BASIC
-3.07
□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
RNU6-834P-201
ENST00000362367
110 nt
BASIC
-3.08
□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
Y_RNA.211-201
ENST00000364164
101 nt
BASIC
-3.08
□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
RNU6-1056P-201
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BASIC
-3.09
□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
RNY3P8-201
ENST00000411366
126 nt
BASIC
-3.09
□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
SNORA40.13-201
ENST00000516379
120 nt
BASIC
-3.09
□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
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82 nt
BASIC
-3.09
□□□□□ -2.9
STX4
Q12846
Y_RNA.321-201
ENST00000365149
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BASIC
-3.1
□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
RNU6-675P-201
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BASIC
-3.1
□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
Y_RNA.703-201
ENST00000516846
111 nt
BASIC
-3.1
□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
MIR450A1-201
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91 nt
BASIC
-3.11
□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
Y_RNA.273-201
ENST00000364703
102 nt
BASIC
-3.11
□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
Y_RNA.591-201
ENST00000410228
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BASIC
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□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
AL365222.1-201
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BASIC
-3.11
□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
Y_RNA.709-201
ENST00000516952
92 nt
BASIC
-3.12
□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
RNU6-1094P-201
ENST00000362416
104 nt
BASIC
-3.13
□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
RNU6-315P-201
ENST00000362666
107 nt
BASIC
-3.13
□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
Y_RNA.564-201
ENST00000384708
106 nt
BASIC
-3.13
□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
MIR548W-201
ENST00000581970
74 nt
BASIC
-3.13
□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
MIR3133-201
ENST00000583157
78 nt
BASIC
-3.13
□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
snoU13.10-201
ENST00000459301
103 nt
BASIC
-3.14
□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
SNORD18C-201
ENST00000362704
69 nt
BASIC
-3.15
□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
SNORD115-31-201
ENST00000365318
82 nt
BASIC
-3.15
□□□□□ -2.91
STX4
Q12846
RNU6-974P-201
ENST00000384099
108 nt
BASIC
-3.15
□□□□□ -2.91
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