Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GTF3C1Q12789 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.54
GTF3C1Q12789 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
GTF3C1Q12789 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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GTF3C1Q12789 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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GTF3C1Q12789 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
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GTF3C1Q12789 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
GTF3C1Q12789 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
GTF3C1Q12789 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
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