Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ACTBP60709 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ACTBP60709 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ACTBP60709 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
ACTBP60709 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ACTBP60709 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
ACTBP60709 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ACTBP60709 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ACTBP60709 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ACTBP60709 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ACTBP60709 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ACTBP60709 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ACTBP60709 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ACTBP60709 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ACTBP60709 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
ACTBP60709 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
ACTBP60709 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ACTBP60709 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ACTBP60709 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ACTBP60709 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ACTBP60709 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
ACTBP60709 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
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ACTBP60709 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
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ACTBP60709 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
ACTBP60709 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.47□□□□□ -2.8
ACTBP60709 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ACTBP60709 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ACTBP60709 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ACTBP60709 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ACTBP60709 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
ACTBP60709 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ACTBP60709 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
ACTBP60709 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
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ACTBP60709 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
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ACTBP60709 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
ACTBP60709 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
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ACTBP60709 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
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ACTBP60709 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
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ACTBP60709 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
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