Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CASQ1P31415 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.96□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
CASQ1P31415 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CASQ1P31415 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CASQ1P31415 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
CASQ1P31415 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CASQ1P31415 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CASQ1P31415 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CASQ1P31415 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CASQ1P31415 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CASQ1P31415 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
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CASQ1P31415 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
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CASQ1P31415 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CASQ1P31415 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.03□□□□□ -2.89
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CASQ1P31415 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
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CASQ1P31415 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
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CASQ1P31415 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
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CASQ1P31415 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-3.05□□□□□ -2.9
CASQ1P31415 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CASQ1P31415 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CASQ1P31415 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CASQ1P31415 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CASQ1P31415 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CASQ1P31415 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CASQ1P31415 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CASQ1P31415 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CASQ1P31415 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CASQ1P31415 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
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CASQ1P31415 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
CASQ1P31415 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
CASQ1P31415 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
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CASQ1P31415 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
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CASQ1P31415 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
CASQ1P31415 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
CASQ1P31415 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
CASQ1P31415 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
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CASQ1P31415 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
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CASQ1P31415 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
CASQ1P31415 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
CASQ1P31415 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
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