Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.07□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ATG4CQ96DT6 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
ATG4CQ96DT6 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
ATG4CQ96DT6 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATG4CQ96DT6 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ATG4CQ96DT6 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATG4CQ96DT6 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ATG4CQ96DT6 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATG4CQ96DT6 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ATG4CQ96DT6 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATG4CQ96DT6 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATG4CQ96DT6 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ATG4CQ96DT6 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ATG4CQ96DT6 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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ATG4CQ96DT6 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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ATG4CQ96DT6 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ATG4CQ96DT6 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATG4CQ96DT6 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ATG4CQ96DT6 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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ATG4CQ96DT6 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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ATG4CQ96DT6 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATG4CQ96DT6 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ATG4CQ96DT6 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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ATG4CQ96DT6 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ATG4CQ96DT6 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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ATG4CQ96DT6 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATG4CQ96DT6 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATG4CQ96DT6 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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ATG4CQ96DT6 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
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ATG4CQ96DT6 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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ATG4CQ96DT6 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATG4CQ96DT6 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATG4CQ96DT6 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATG4CQ96DT6 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATG4CQ96DT6 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
ATG4CQ96DT6 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATG4CQ96DT6 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATG4CQ96DT6 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
ATG4CQ96DT6 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
ATG4CQ96DT6 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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