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Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4
SSX8, Protein SSX8, human
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RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
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Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
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Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SSX8
Q7RTT4
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SSX8
Q7RTT4
RNU6-797P-201
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109 nt
BASIC
-2.49
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
Y_RNA.712-201
ENST00000517011
92 nt
BASIC
-2.49
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
U6.95-201
ENST00000636931
70 nt
BASIC
-2.49
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
RNU6-194P-201
ENST00000363862
105 nt
BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
RNU6-867P-201
ENST00000364956
107 nt
BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
MIR519C-201
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BASIC
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□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
RNU6-1211P-201
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BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
RNU6-1108P-201
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104 nt
BASIC
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□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
Y_RNA.812-201
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BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
Y_RNA.784-201
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101 nt
BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
Y_RNA.787-201
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BASIC
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□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
Y_RNA.780-201
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101 nt
BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
Y_RNA.801-201
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101 nt
BASIC
-2.5
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
RNU6-1107P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
MTND5P41-201
ENST00000517498
206 nt
BASIC
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□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
MIR3123-201
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BASIC
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□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
RNU6-698P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
RNU6-34P-201
ENST00000364874
107 nt
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□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
TRAJ61-201
ENST00000390479
60 nt
APPRIS P1
BASIC
-2.52
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
RNU6-1111P-201
ENST00000391118
107 nt
BASIC
-2.52
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
MIR4503-201
ENST00000582187
83 nt
BASIC
-2.52
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
Y_RNA.71-201
ENST00000362892
104 nt
BASIC
-2.53
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
RNU4-88P-201
ENST00000411220
86 nt
BASIC
-2.53
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
Y_RNA.781-201
ENST00000620301
103 nt
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-2.53
□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
U2.18-201
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84 nt
BASIC
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□□□□□ -2.81
SSX8
Q7RTT4
RNU6-563P-201
ENST00000364872
108 nt
BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
MT-TM-201
ENST00000387377
68 nt
BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
Y_RNA.591-201
ENST00000410228
104 nt
BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
RNU6-257P-201
ENST00000410238
98 nt
BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
RNU6-162P-201
ENST00000516228
103 nt
BASIC
-2.54
□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
MIR3170-201
ENST00000582699
77 nt
BASIC
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□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
MIR3675-201
ENST00000583661
73 nt
BASIC
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□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
U4.4-201
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117 nt
BASIC
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□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
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132 nt
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□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
Y_RNA.586-201
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□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
U7.3-201
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□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
Y_RNA.107-201
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BASIC
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□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
MIR590-201
ENST00000385008
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BASIC
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□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
RNU6-624P-201
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107 nt
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□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
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Q7RTT4
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Q7RTT4
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SSX8
Q7RTT4
MIR548V-201
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Q7RTT4
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□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
ST7-OT3_1.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.82
SSX8
Q7RTT4
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Q7RTT4
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RNU6-1267P-201
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Q7RTT4
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Q7RTT4
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Q7RTT4
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Q7RTT4
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Q7RTT4
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BASIC
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□□□□□ -2.83
SSX8
Q7RTT4
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BASIC
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Q7RTT4
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Q7RTT4
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Q7RTT4
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Q7RTT4
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Q7RTT4
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Q7RTT4
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Q7RTT4
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SSX8
Q7RTT4
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SSX8
Q7RTT4
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SSX8
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Q7RTT4
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SSX8
Q7RTT4
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SSX8
Q7RTT4
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BASIC
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SSX8
Q7RTT4
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BASIC
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SSX8
Q7RTT4
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Q7RTT4
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Q7RTT4
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SSX8
Q7RTT4
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SSX8
Q7RTT4
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SSX8
Q7RTT4
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□□□□□ -2.84
SSX8
Q7RTT4
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BASIC
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SSX8
Q7RTT4
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□□□□□ -2.84
SSX8
Q7RTT4
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BASIC
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Q7RTT4
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SSX8
Q7RTT4
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SSX8
Q7RTT4
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BASIC
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Q7RTT4
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SSX8
Q7RTT4
RNU6-1081P-201
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BASIC
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SSX8
Q7RTT4
SNORA27.2-201
ENST00000363365
126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.84
SSX8
Q7RTT4
Y_RNA.290-201
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Q7RTT4
SPRY4-IT1_2.1-201
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121 nt
BASIC
-2.71
□□□□□ -2.84
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