Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CCBE1Q6UXH8 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.9 ms