Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
FOXD1Q16676 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
FOXD1Q16676 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
FOXD1Q16676 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD1Q16676 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC2.57□□□□□ -2
FOXD1Q16676 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD1Q16676 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD1Q16676 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
FOXD1Q16676 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
FOXD1Q16676 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD1Q16676 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD1Q16676 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD1Q16676 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD1Q16676 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXD1Q16676 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
FOXD1Q16676 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FOXD1Q16676 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RNU6-1024P-201ENST00000384199 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXD1Q16676 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXD1Q16676 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXD1Q16676 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD1Q16676 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
FOXD1Q16676 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
FOXD1Q16676 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD1Q16676 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD1Q16676 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
FOXD1Q16676 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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