Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TNFAIP1Q13829 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TNFAIP1Q13829 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TNFAIP1Q13829 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TNFAIP1Q13829 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TNFAIP1Q13829 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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TNFAIP1Q13829 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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TNFAIP1Q13829 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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TNFAIP1Q13829 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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TNFAIP1Q13829 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
TNFAIP1Q13829 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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TNFAIP1Q13829 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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TNFAIP1Q13829 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
TNFAIP1Q13829 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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TNFAIP1Q13829 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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TNFAIP1Q13829 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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TNFAIP1Q13829 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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TNFAIP1Q13829 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TNFAIP1Q13829 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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