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Protein–RNA interactions for Protein: Q13619
CUL4A, Cullin-4A, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL4A
Q13619
RNU6-686P-201
ENST00000364839
107 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
SNORA26.4-201
ENST00000391188
123 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
RNU6-807P-201
ENST00000516805
107 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
MIR3675-201
ENST00000583661
73 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
SNORD115-33-201
ENST00000363723
82 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
RNU6-497P-201
ENST00000365316
104 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
AL603908.1-201
ENST00000406098
201 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
Y_RNA.611-201
ENST00000410682
108 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
SNX3P1X-201
ENST00000414887
175 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
U2.7-201
ENST00000619197
100 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
MIR548C-201
ENST00000384815
97 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
MIR29B1-201
ENST00000385015
81 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
AC138207.3-201
ENST00000585289
166 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
SNORA63.4-201
ENST00000362763
126 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
SNORA8.1-201
ENST00000384250
140 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
MIR488-201
ENST00000365739
83 nt
BASIC
-1.71
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
RNU6-129P-201
ENST00000391022
107 nt
BASIC
-1.71
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
ULK3-223
ENST00000631115
126 nt
TSL 5
BASIC
-1.71
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
RNU6-640P-201
ENST00000363693
105 nt
BASIC
-1.72
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
RNU6-147P-201
ENST00000383983
107 nt
BASIC
-1.72
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
RNU6-919P-201
ENST00000516731
104 nt
BASIC
-1.72
□□□□□ -2.68
CUL4A
Q13619
RNU6-330P-201
ENST00000363015
107 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
Y_RNA.468-201
ENST00000384298
102 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
SNORD63.1-201
ENST00000516178
80 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
RNU6-844P-201
ENST00000517175
102 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
FAS-AS1.1-201
ENST00000615327
126 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
RNU6-215P-201
ENST00000365169
102 nt
BASIC
-1.74
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
RNU6-789P-201
ENST00000517105
102 nt
BASIC
-1.74
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
MIRLET7A1-201
ENST00000362295
80 nt
BASIC
-1.75
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
RNU6-675P-201
ENST00000384236
104 nt
BASIC
-1.75
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
RNU6-380P-201
ENST00000410207
107 nt
BASIC
-1.75
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
AC074348.1-201
ENST00000426503
132 nt
BASIC
-1.75
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
AC006160.2-201
ENST00000637708
154 nt
BASIC
-1.75
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
SNORD20-201
ENST00000384550
80 nt
BASIC
-1.76
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
AL353691.2-201
ENST00000443795
59 nt
BASIC
-1.76
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
RNU6-1238P-201
ENST00000517215
102 nt
BASIC
-1.76
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
MIR6818-201
ENST00000621576
65 nt
BASIC
-1.76
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
RNU6-478P-201
ENST00000363904
110 nt
BASIC
-1.77
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
Y_RNA.365-201
ENST00000365537
102 nt
BASIC
-1.77
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
RNU6-604P-201
ENST00000390917
100 nt
BASIC
-1.77
□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
MIR1297-201
ENST00000637311
77 nt
BASIC
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□□□□□ -2.69
CUL4A
Q13619
SNORD45.1-201
ENST00000363181
77 nt
BASIC
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□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
RNU6-732P-201
ENST00000516033
103 nt
BASIC
-1.79
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
hsa-mir-3607.1-201
ENST00000637229
79 nt
BASIC
-1.79
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
RNU6-1134P-201
ENST00000365156
101 nt
BASIC
-1.8
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
RNU7-134P-201
ENST00000458997
64 nt
BASIC
-1.8
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
SNORD115-22-201
ENST00000364456
82 nt
BASIC
-1.81
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
RNU7-88P-201
ENST00000458752
63 nt
BASIC
-1.81
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
MIR548AG1-201
ENST00000579932
66 nt
BASIC
-1.81
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
HLA-S-202
ENST00000425174
53 nt
BASIC
-1.82
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
RNA5SP461-201
ENST00000516451
104 nt
BASIC
-1.82
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
U7.5-201
ENST00000517224
61 nt
BASIC
-1.82
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
Y_RNA.17-201
ENST00000362433
111 nt
BASIC
-1.83
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
RNU6-246P-201
ENST00000384702
107 nt
BASIC
-1.83
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
RNU6-1089P-201
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104 nt
BASIC
-1.83
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
MIR198-201
ENST00000637333
62 nt
BASIC
-1.83
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
MIR601-201
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BASIC
-1.84
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
RNU7-174P-201
ENST00000516248
59 nt
BASIC
-1.84
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
MIR4484-201
ENST00000582855
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BASIC
-1.84
□□□□□ -2.7
CUL4A
Q13619
Y_RNA.532-201
ENST00000384590
113 nt
BASIC
-1.85
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
Y_RNA.607-201
ENST00000410597
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BASIC
-1.85
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
MIR1468-201
ENST00000410600
86 nt
BASIC
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□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
RNU6-982P-201
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102 nt
BASIC
-1.85
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
Y_RNA.219-201
ENST00000364232
113 nt
BASIC
-1.86
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
RNU4-61P-201
ENST00000411243
107 nt
BASIC
-1.86
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
MIR548AI-201
ENST00000579940
88 nt
BASIC
-1.86
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
IGLL4P-201
ENST00000614590
133 nt
BASIC
-1.86
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
TRAJ53-201
ENST00000390485
66 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.87
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
MTND4LP1-201
ENST00000446263
157 nt
BASIC
-1.87
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
snoMBII-202.2-201
ENST00000517263
86 nt
BASIC
-1.87
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
MIR429-201
ENST00000362106
83 nt
BASIC
-1.88
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
RNA5SP26-201
ENST00000362406
119 nt
BASIC
-1.88
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
RNU6-1216P-201
ENST00000362590
107 nt
BASIC
-1.88
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
Y_RNA.236-201
ENST00000364427
111 nt
BASIC
-1.88
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
Y_RNA.426-201
ENST00000384068
113 nt
BASIC
-1.88
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
RNU6-576P-201
ENST00000390854
102 nt
BASIC
-1.88
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
RNA5SP180-201
ENST00000516181
101 nt
BASIC
-1.88
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
MIR4490-201
ENST00000582647
84 nt
BASIC
-1.88
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
Y_RNA.74-201
ENST00000362911
99 nt
BASIC
-1.89
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
MIR527-201
ENST00000385244
85 nt
BASIC
-1.89
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
MIR8485-201
ENST00000401372
91 nt
BASIC
-1.89
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
MIR5591-201
ENST00000578248
65 nt
BASIC
-1.89
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
RNY1P1-201
ENST00000364372
112 nt
BASIC
-1.9
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
MIR507-201
ENST00000385234
94 nt
BASIC
-1.9
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
RNU6-168P-201
ENST00000516189
101 nt
BASIC
-1.9
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
RNU6-406P-201
ENST00000516470
107 nt
BASIC
-1.9
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
MIR8053-201
ENST00000613344
75 nt
BASIC
-1.9
□□□□□ -2.71
CUL4A
Q13619
RNU6-315P-201
ENST00000362666
107 nt
BASIC
-1.91
□□□□□ -2.72
CUL4A
Q13619
RNU6-1131P-201
ENST00000364955
107 nt
BASIC
-1.91
□□□□□ -2.72
CUL4A
Q13619
RNU6-44P-201
ENST00000384045
107 nt
BASIC
-1.91
□□□□□ -2.72
CUL4A
Q13619
RNU6-458P-201
ENST00000384179
107 nt
BASIC
-1.91
□□□□□ -2.72
CUL4A
Q13619
Y_RNA.593-201
ENST00000410292
98 nt
BASIC
-1.91
□□□□□ -2.72
CUL4A
Q13619
RNU6-1174P-201
ENST00000517278
101 nt
BASIC
-1.91
□□□□□ -2.72
CUL4A
Q13619
MIR4770-201
ENST00000579149
58 nt
BASIC
-1.91
□□□□□ -2.72
CUL4A
Q13619
U6.58-201
ENST00000613107
107 nt
BASIC
-1.91
□□□□□ -2.72
CUL4A
Q13619
MIR5683-201
ENST00000636514
76 nt
BASIC
-1.91
□□□□□ -2.72
CUL4A
Q13619
RNU6-698P-201
ENST00000363523
107 nt
BASIC
-1.93
□□□□□ -2.72
CUL4A
Q13619
RNU6-34P-201
ENST00000364874
107 nt
BASIC
-1.93
□□□□□ -2.72
CUL4A
Q13619
Y_RNA.181-201
ENST00000363872
101 nt
BASIC
-1.95
□□□□□ -2.72
CUL4A
Q13619
SNORD19-201
ENST00000391191
68 nt
BASIC
-1.95
□□□□□ -2.72
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