Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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FOXC1Q12948 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
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FOXC1Q12948 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
FOXC1Q12948 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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FOXC1Q12948 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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FOXC1Q12948 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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FOXC1Q12948 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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FOXC1Q12948 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC1□□□□□ -2.25
FOXC1Q12948 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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FOXC1Q12948 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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FOXC1Q12948 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
FOXC1Q12948 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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FOXC1Q12948 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
FOXC1Q12948 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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FOXC1Q12948 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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FOXC1Q12948 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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FOXC1Q12948 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
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FOXC1Q12948 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXC1Q12948 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
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FOXC1Q12948 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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FOXC1Q12948 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
FOXC1Q12948 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXC1Q12948 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXC1Q12948 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
FOXC1Q12948 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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