Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.6 ms