Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ECM1Q16610 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
ECM1Q16610 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECM1Q16610 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
ECM1Q16610 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECM1Q16610 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECM1Q16610 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
ECM1Q16610 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECM1Q16610 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECM1Q16610 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECM1Q16610 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECM1Q16610 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECM1Q16610 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
ECM1Q16610 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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ECM1Q16610 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
ECM1Q16610 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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ECM1Q16610 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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ECM1Q16610 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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ECM1Q16610 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECM1Q16610 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
ECM1Q16610 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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ECM1Q16610 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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ECM1Q16610 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ECM1Q16610 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ECM1Q16610 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ECM1Q16610 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ECM1Q16610 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ECM1Q16610 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ECM1Q16610 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ECM1Q16610 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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