Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
VAMP3Q15836 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
VAMP3Q15836 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
VAMP3Q15836 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
VAMP3Q15836 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
VAMP3Q15836 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
VAMP3Q15836 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
VAMP3Q15836 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
VAMP3Q15836 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
VAMP3Q15836 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.76□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
VAMP3Q15836 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
VAMP3Q15836 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
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VAMP3Q15836 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-2.88□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
VAMP3Q15836 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
VAMP3Q15836 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
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