Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SQLEQ14534 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SQLEQ14534 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
SQLEQ14534 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SQLEQ14534 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.9 ms