Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PDE6HQ13956 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PDE6HQ13956 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PDE6HQ13956 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PDE6HQ13956 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PDE6HQ13956 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.1 ms