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Protein–RNA interactions for Protein: Q13619
CUL4A, Cullin-4A, human
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759 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CUL4A
Q13619
AL031737.1-201
ENST00000450125
223 nt
BASIC
-1.34
□□□□□ -2.62
CUL4A
Q13619
RNU6-681P-201
ENST00000364012
104 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
MIR1255B2-201
ENST00000408618
67 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
uc_338.19-201
ENST00000616808
99 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
MIR6738-201
ENST00000619620
64 nt
BASIC
-1.35
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
AL500527.2-201
ENST00000454105
95 nt
BASIC
-1.36
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
MIR409-201
ENST00000362237
79 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
SNORD115-27-201
ENST00000364430
82 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
CYP3A54P-201
ENST00000566950
75 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
MIR4324-201
ENST00000584846
72 nt
BASIC
-1.37
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
SNORD115-37-201
ENST00000363768
82 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
MIR521-2-201
ENST00000384818
87 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
MIR147A-201
ENST00000385079
72 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
SNORD77.2-201
ENST00000391045
68 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
RNY1P9-201
ENST00000532431
109 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
MIR4499-201
ENST00000584834
69 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
AC132825.6-201
ENST00000638861
357 nt
BASIC
-1.38
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
SNORD57-201
ENST00000448188
72 nt
BASIC
-1.39
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
RNU6-1290P-201
ENST00000362957
109 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
RNU6-340P-201
ENST00000364005
107 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
RNU6-431P-201
ENST00000383874
107 nt
BASIC
-1.4
□□□□□ -2.63
CUL4A
Q13619
TRAJ61-201
ENST00000390479
60 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.41
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
Y_RNA.264-201
ENST00000364665
102 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
Y_RNA.273-201
ENST00000364703
102 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
RNU6-24P-201
ENST00000384440
107 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
MIR4464-201
ENST00000580818
92 nt
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
TRAJ37-201
ENST00000612375
65 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.42
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
MIR450A1-201
ENST00000362262
91 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
RNU6-10P-201
ENST00000384036
107 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
RNU6-1246P-201
ENST00000391064
107 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
MIR3910-1-201
ENST00000580936
111 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
MIR4668-201
ENST00000582284
70 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
MIR6739-201
ENST00000622461
75 nt
BASIC
-1.43
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
RNU6-633P-201
ENST00000362612
103 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
MIR587-201
ENST00000384845
96 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
SNORD64-201
ENST00000386683
67 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
RNU6ATAC29P-201
ENST00000408088
125 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
RNU2-51P-201
ENST00000410708
197 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
AC140658.3-201
ENST00000567603
271 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
AL445584.3-201
ENST00000617173
78 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
HOTAIRM1_3.1-201
ENST00000619974
59 nt
BASIC
-1.44
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
MIR378F-201
ENST00000578143
78 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
MIR6888-201
ENST00000621977
67 nt
BASIC
-1.45
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
MIR382-201
ENST00000637119
76 nt
BASIC
-1.46
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
Y_RNA.244-201
ENST00000364484
109 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
Y_RNA.514-201
ENST00000384528
112 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
RNA5SP266-201
ENST00000410273
108 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
SCARNA18B-201
ENST00000458806
135 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
RNU7-154P-201
ENST00000516194
62 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
SNORA40.13-201
ENST00000516379
120 nt
BASIC
-1.47
□□□□□ -2.64
CUL4A
Q13619
SNORD114-17-201
ENST00000364699
75 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
AL035461.1-201
ENST00000421490
332 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
RNU6-1108P-201
ENST00000516308
104 nt
BASIC
-1.48
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
RNU6-924P-201
ENST00000362926
108 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
SNORD116-22-201
ENST00000384430
92 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
RNY4P18-201
ENST00000391107
89 nt
BASIC
-1.49
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
Y_RNA.583-201
ENST00000391033
113 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
AC093729.1-201
ENST00000513074
128 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
MIR3165-201
ENST00000579874
75 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
AP001318.4-201
ENST00000616637
121 nt
BASIC
-1.5
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
RNA5SP192-201
ENST00000364404
120 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
RNU6-1325P-201
ENST00000364905
105 nt
BASIC
-1.51
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
Y_RNA.620-201
ENST00000411009
88 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
RNU6-518P-201
ENST00000516056
96 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
MALAT1.1-201
ENST00000618249
95 nt
BASIC
-1.52
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
Y_RNA.495-201
ENST00000384435
112 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
AL021921.1-201
ENST00000442774
93 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
MIR4306-201
ENST00000583390
91 nt
BASIC
-1.53
□□□□□ -2.65
CUL4A
Q13619
RNU6-624P-201
ENST00000363411
107 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
CUL4A
Q13619
MIR519A2-201
ENST00000384990
87 nt
BASIC
-1.55
□□□□□ -2.66
CUL4A
Q13619
SNORD113-1-201
ENST00000365321
69 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
CUL4A
Q13619
MIR3115-201
ENST00000577915
68 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
CUL4A
Q13619
AL627230.5-201
ENST00000619807
58 nt
BASIC
-1.56
□□□□□ -2.66
CUL4A
Q13619
Y_RNA.629-201
ENST00000411368
105 nt
BASIC
-1.57
□□□□□ -2.66
CUL4A
Q13619
RNU6-755P-201
ENST00000364400
103 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
CUL4A
Q13619
Y_RNA.457-201
ENST00000384237
111 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
CUL4A
Q13619
RNU6-1157P-201
ENST00000384456
106 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
CUL4A
Q13619
Y_RNA.698-201
ENST00000516798
118 nt
BASIC
-1.58
□□□□□ -2.66
CUL4A
Q13619
RNA5SP331-201
ENST00000364986
107 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
CUL4A
Q13619
RNU6-402P-201
ENST00000410678
103 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
CUL4A
Q13619
AL353795.2-201
ENST00000431804
425 nt
TSL 2
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
CUL4A
Q13619
snoU83B.1-201
ENST00000517136
88 nt
BASIC
-1.59
□□□□□ -2.66
CUL4A
Q13619
RNU6-219P-201
ENST00000364728
107 nt
BASIC
-1.6
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
RNU6-32P-201
ENST00000383948
107 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
RNU6-13P-201
ENST00000384248
107 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
RNU6-12P-201
ENST00000384604
107 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
RNU6-41P-201
ENST00000384741
107 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
RNU6-656P-201
ENST00000516785
107 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
RNU6-557P-201
ENST00000516842
110 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
AL606753.1-201
ENST00000427435
87 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
MIR548BB-201
ENST00000626714
66 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
MIR4320-201
ENST00000636981
65 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
Y_RNA.348-201
ENST00000365403
103 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
RNU6-303P-201
ENST00000517091
106 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
RNU6-706P-201
ENST00000517229
104 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
RNU6-1233P-201
ENST00000362922
102 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
RNU6-1081P-201
ENST00000384537
107 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
Y_RNA.613-201
ENST00000410726
97 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
RNU6-267P-201
ENST00000516714
103 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
CUL4A
Q13619
RNU6-645P-201
ENST00000364649
106 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
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