Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
KRR1Q13601 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
KRR1Q13601 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
KRR1Q13601 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
KRR1Q13601 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms