Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAF1Q13077 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAF1Q13077 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRAF1Q13077 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAF1Q13077 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAF1Q13077 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRAF1Q13077 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAF1Q13077 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAF1Q13077 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRAF1Q13077 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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TRAF1Q13077 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRAF1Q13077 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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TRAF1Q13077 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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TRAF1Q13077 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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TRAF1Q13077 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAF1Q13077 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAF1Q13077 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAF1Q13077 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAF1Q13077 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAF1Q13077 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAF1Q13077 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAF1Q13077 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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TRAF1Q13077 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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TRAF1Q13077 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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TRAF1Q13077 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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TRAF1Q13077 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
TRAF1Q13077 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
TRAF1Q13077 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRAF1Q13077 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRAF1Q13077 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
TRAF1Q13077 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRAF1Q13077 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRAF1Q13077 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRAF1Q13077 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
TRAF1Q13077 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
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