Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXC1Q12948 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXC1Q12948 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXC1Q12948 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXC1Q12948 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXC1Q12948 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXC1Q12948 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXC1Q12948 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXC1Q12948 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXC1Q12948 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXC1Q12948 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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FOXC1Q12948 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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FOXC1Q12948 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
FOXC1Q12948 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXC1Q12948 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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FOXC1Q12948 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXC1Q12948 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXC1Q12948 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXC1Q12948 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
FOXC1Q12948 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXC1Q12948 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FOXC1Q12948 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
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FOXC1Q12948 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FOXC1Q12948 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXC1Q12948 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FOXC1Q12948 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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FOXC1Q12948 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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FOXC1Q12948 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXC1Q12948 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
FOXC1Q12948 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXC1Q12948 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXC1Q12948 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXC1Q12948 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXC1Q12948 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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