Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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GTF3C1Q12789 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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GTF3C1Q12789 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
GTF3C1Q12789 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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GTF3C1Q12789 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
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GTF3C1Q12789 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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GTF3C1Q12789 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
GTF3C1Q12789 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
GTF3C1Q12789 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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