Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CLDN8P56748 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.42□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CLDN8P56748 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CLDN8P56748 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CLDN8P56748 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 345.9 ms