Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
CASQ1P31415 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
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CASQ1P31415 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-2.59□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
CASQ1P31415 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CASQ1P31415 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
CASQ1P31415 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CASQ1P31415 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CASQ1P31415 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
CASQ1P31415 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
CASQ1P31415 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
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CASQ1P31415 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CASQ1P31415 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CASQ1P31415 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CASQ1P31415 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CASQ1P31415 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CASQ1P31415 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
CASQ1P31415 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CASQ1P31415 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CASQ1P31415 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
CASQ1P31415 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CASQ1P31415 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CASQ1P31415 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CASQ1P31415 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
CASQ1P31415 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
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