Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
PTPRDP23468 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
PTPRDP23468 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.29□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
PTPRDP23468 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
PTPRDP23468 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.1 ms