Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
LINC00587B1AMM8 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
LINC00587B1AMM8 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
LINC00587B1AMM8 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-5.15□□□□□ -3.23
LINC00587B1AMM8 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-5.15□□□□□ -3.23
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-5.16□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-5.18□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-5.19□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-5.2□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-5.21□□□□□ -3.24
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-5.22□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-5.22□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-5.22□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-5.22□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-5.22□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-5.23□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-5.24□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-5.25□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-5.25□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-5.26□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-5.26□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-5.26□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-5.26□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-5.27□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-5.28□□□□□ -3.25
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-5.29□□□□□ -3.26
LINC00587B1AMM8 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-5.29□□□□□ -3.26
LINC00587B1AMM8 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-5.29□□□□□ -3.26
LINC00587B1AMM8 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-5.31□□□□□ -3.26
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-5.32□□□□□ -3.26
LINC00587B1AMM8 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-5.32□□□□□ -3.26
LINC00587B1AMM8 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
LINC00587B1AMM8 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
LINC00587B1AMM8 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
LINC00587B1AMM8 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-5.33□□□□□ -3.26
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-5.35□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-5.36□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-5.37□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-5.37□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-5.38□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-5.39□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-5.4□□□□□ -3.27
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-5.41□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-5.42□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-5.42□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-5.43□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-5.44□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-5.45□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-5.46□□□□□ -3.28
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
LINC00587B1AMM8 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-5.47□□□□□ -3.29
LINC00587B1AMM8 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
LINC00587B1AMM8 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-5.47□□□□□ -3.29
LINC00587B1AMM8 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
LINC00587B1AMM8 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
LINC00587B1AMM8 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-5.48□□□□□ -3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 409.9 ms