Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5cP41230 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5cP41230 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5cP41230 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5cP41230 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5cP41230 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5cP41230 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5cP41230 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5cP41230 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5cP41230 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5cP41230 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kdm5cP41230 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kdm5cP41230 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms