Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UIMC1Q96RL1 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UIMC1Q96RL1 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.37□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
UIMC1Q96RL1 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
UIMC1Q96RL1 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
UIMC1Q96RL1 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
UIMC1Q96RL1 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
UIMC1Q96RL1 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
UIMC1Q96RL1 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
UIMC1Q96RL1 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UIMC1Q96RL1 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UIMC1Q96RL1 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UIMC1Q96RL1 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
UIMC1Q96RL1 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
UIMC1Q96RL1 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
UIMC1Q96RL1 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 625 ms