Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCBE1Q6UXH8 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCBE1Q6UXH8 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCBE1Q6UXH8 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CCBE1Q6UXH8 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 387.4 ms