Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-4.19□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-4.2□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-4.21□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
HMGN3Q15651 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-4.28□□□□□ -3.09
HMGN3Q15651 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
HMGN3Q15651 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
HMGN3Q15651 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
HMGN3Q15651 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-4.29□□□□□ -3.1
HMGN3Q15651 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
HMGN3Q15651 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
HMGN3Q15651 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-4.3□□□□□ -3.1
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