Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
LAPTM4AQ15012 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
LAPTM4AQ15012 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 MIR548T-201ENST00000408369 74 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAPTM4AQ15012 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 RNU6-1091P-201ENST00000363945 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
LAPTM4AQ15012 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
LAPTM4AQ15012 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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