Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
CACNA1CQ13936 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
CACNA1CQ13936 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
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