Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RAPGEF1Q13905 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAPGEF1Q13905 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RAPGEF1Q13905 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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