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Protein–RNA interactions for Protein: Q13277
STX3, Syntaxin-3, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
STX3
Q13277
AC141273.2-201
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130 nt
BASIC
-2.16
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
AL035470.1-201
ENST00000622571
220 nt
BASIC
-2.16
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
Y_RNA.543-201
ENST00000384649
107 nt
BASIC
-2.17
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
RNU6-1262P-201
ENST00000516217
96 nt
BASIC
-2.17
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
RNU6-807P-201
ENST00000516805
107 nt
BASIC
-2.17
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
RNU6-696P-201
ENST00000390834
107 nt
BASIC
-2.18
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
TRAJ37-201
ENST00000612375
65 nt
APPRIS P1
BASIC
-2.18
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
Y_RNA.236-201
ENST00000364427
111 nt
BASIC
-2.19
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
RNU6-841P-201
ENST00000383872
107 nt
BASIC
-2.19
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
Y_RNA.396-201
ENST00000383949
103 nt
BASIC
-2.19
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
AL158147.1-201
ENST00000443970
75 nt
BASIC
-2.19
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
RNU6-752P-201
ENST00000516376
102 nt
BASIC
-2.19
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
AC022559.1-201
ENST00000520905
205 nt
BASIC
-2.19
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
Y_RNA.65-201
ENST00000362846
100 nt
BASIC
-2.2
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
RNU4-11P-201
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132 nt
BASIC
-2.2
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
Y_RNA.449-201
ENST00000384187
102 nt
BASIC
-2.2
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
SNX3P1X-201
ENST00000414887
175 nt
BASIC
-2.2
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
AC120024.2-201
ENST00000576526
175 nt
BASIC
-2.2
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
MIR548AM-201
ENST00000584298
74 nt
BASIC
-2.2
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
SNORD45B-201
ENST00000364617
72 nt
BASIC
-2.21
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
RNU6-598P-201
ENST00000364017
105 nt
BASIC
-2.22
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
Y_RNA.309-201
ENST00000365046
111 nt
BASIC
-2.22
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
RNU6ATAC32P-201
ENST00000516026
76 nt
BASIC
-2.22
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
MIR4796-201
ENST00000580742
81 nt
BASIC
-2.22
□□□□□ -2.76
STX3
Q13277
Y_RNA.109-201
ENST00000363215
102 nt
BASIC
-2.23
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
Y_RNA.233-201
ENST00000364407
101 nt
BASIC
-2.23
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
Y_RNA.282-201
ENST00000364793
102 nt
BASIC
-2.23
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
AL118496.2-201
ENST00000448300
230 nt
BASIC
-2.23
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
RNU7-174P-201
ENST00000516248
59 nt
BASIC
-2.23
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
AC025166.1-201
ENST00000612411
163 nt
BASIC
-2.23
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
Y_RNA.138-201
ENST00000363462
102 nt
BASIC
-2.24
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
RNU6-340P-201
ENST00000364005
107 nt
BASIC
-2.24
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
Y_RNA.202-201
ENST00000364083
110 nt
BASIC
-2.24
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
AL035461.1-201
ENST00000421490
332 nt
BASIC
-2.24
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
AC012531.4-201
ENST00000616509
177 nt
BASIC
-2.24
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
Y_RNA.11-201
ENST00000362375
109 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
Y_RNA.74-201
ENST00000362911
99 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
SNORD58C-201
ENST00000365223
64 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
RNU6-795P-201
ENST00000516323
103 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
RNU6-635P-201
ENST00000516651
102 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
MIR4679-2-201
ENST00000578358
77 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
MIR3171-201
ENST00000584270
74 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
AP001340.1-201
ENST00000624405
217 nt
BASIC
-2.25
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
Y_RNA.10-201
ENST00000362371
110 nt
BASIC
-2.26
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
RNU6-587P-201
ENST00000391282
106 nt
BASIC
-2.26
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
RNU6-980P-201
ENST00000516925
103 nt
BASIC
-2.26
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
MIR3144-201
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79 nt
BASIC
-2.26
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
MIR23C-201
ENST00000579846
100 nt
BASIC
-2.26
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
MIR4441-201
ENST00000582623
100 nt
BASIC
-2.26
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
Y_RNA.20-201
ENST00000362479
113 nt
BASIC
-2.27
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
RNU6-645P-201
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BASIC
-2.27
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
Y_RNA.325-201
ENST00000365171
122 nt
BASIC
-2.27
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
SNORD58A-201
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65 nt
BASIC
-2.27
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
RNU6-639P-201
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107 nt
BASIC
-2.27
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
MIR601-201
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79 nt
BASIC
-2.27
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
RNU6-258P-201
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BASIC
-2.27
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
RNU4-88P-201
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86 nt
BASIC
-2.27
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
Y_RNA.630-201
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BASIC
-2.27
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
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BASIC
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□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
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BASIC
-2.27
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
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STX3
Q13277
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STX3
Q13277
Y_RNA.145-201
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BASIC
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STX3
Q13277
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STX3
Q13277
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
MIR548A3-201
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BASIC
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STX3
Q13277
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BASIC
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□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
MIR198-201
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62 nt
BASIC
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STX3
Q13277
CR2-207
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151 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-2.28
□□□□□ -2.77
STX3
Q13277
Y_RNA.211-201
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101 nt
BASIC
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□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
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301 nt
TSL 3
BASIC
-2.29
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
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□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
Y_RNA.180-201
ENST00000363867
113 nt
BASIC
-2.3
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
SNORA33.2-201
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BASIC
-2.3
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
Y_RNA.460-201
ENST00000384255
102 nt
BASIC
-2.3
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
RNU7-153P-201
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62 nt
BASIC
-2.3
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
MIR3170-201
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77 nt
BASIC
-2.3
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
MIR365A-201
ENST00000362260
87 nt
BASIC
-2.31
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
MIR5009-201
ENST00000578736
100 nt
BASIC
-2.31
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
AL450471.1-201
ENST00000447509
127 nt
BASIC
-2.32
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
ST7-OT3_1.1-201
ENST00000619607
74 nt
BASIC
-2.32
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
U4.4-201
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117 nt
BASIC
-2.32
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
Y_RNA.225-201
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97 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
Y_RNA.509-201
ENST00000384506
99 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
Y_RNA.564-201
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106 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
Y_RNA.574-201
ENST00000384766
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BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
RNU6-1267P-201
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107 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
Y_RNA.616-201
ENST00000410835
95 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
RNU6-1135P-201
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103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
RNU4-71P-201
ENST00000516258
113 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
MIR548S-201
ENST00000581352
82 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
Y_RNA.781-201
ENST00000620301
103 nt
BASIC
-2.33
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
RNA5SP405-201
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114 nt
BASIC
-2.34
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
RNU6-682P-201
ENST00000363843
106 nt
BASIC
-2.34
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
Y_RNA.272-201
ENST00000364696
102 nt
BASIC
-2.34
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
RNU6-1034P-201
ENST00000365335
101 nt
BASIC
-2.34
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
Y_RNA.420-201
ENST00000384043
110 nt
BASIC
-2.34
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
Y_RNA.680-201
ENST00000516441
93 nt
BASIC
-2.34
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
AC013734.1-201
ENST00000619329
111 nt
BASIC
-2.34
□□□□□ -2.78
STX3
Q13277
RNA5SP331-201
ENST00000364986
107 nt
BASIC
-2.35
□□□□□ -2.79
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