Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NR1H3Q13133 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NR1H3Q13133 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NR1H3Q13133 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NR1H3Q13133 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NR1H3Q13133 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NR1H3Q13133 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NR1H3Q13133 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NR1H3Q13133 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NR1H3Q13133 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NR1H3Q13133 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NR1H3Q13133 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NR1H3Q13133 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NR1H3Q13133 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
NR1H3Q13133 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NR1H3Q13133 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NR1H3Q13133 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1□□□□□ -2.25
NR1H3Q13133 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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NR1H3Q13133 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
NR1H3Q13133 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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NR1H3Q13133 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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NR1H3Q13133 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NR1H3Q13133 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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NR1H3Q13133 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1H3Q13133 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
NR1H3Q13133 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.29
NR1H3Q13133 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NR1H3Q13133 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NR1H3Q13133 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
NR1H3Q13133 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
NR1H3Q13133 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
NR1H3Q13133 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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