Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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GTF3C1Q12789 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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GTF3C1Q12789 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
GTF3C1Q12789 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
GTF3C1Q12789 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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GTF3C1Q12789 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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GTF3C1Q12789 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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GTF3C1Q12789 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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GTF3C1Q12789 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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GTF3C1Q12789 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
GTF3C1Q12789 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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