Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CASQ1P31415 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CASQ1P31415 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CASQ1P31415 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CASQ1P31415 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CASQ1P31415 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CASQ1P31415 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CASQ1P31415 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CASQ1P31415 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CASQ1P31415 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CASQ1P31415 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CASQ1P31415 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CASQ1P31415 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CASQ1P31415 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.31□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
CASQ1P31415 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
CASQ1P31415 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
CASQ1P31415 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.2 ms