Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
J3KRW8 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
J3KRW8 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
J3KRW8 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
J3KRW8 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
J3KRW8 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
J3KRW8 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
J3KRW8 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
J3KRW8 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
J3KRW8 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
J3KRW8 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
J3KRW8 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
J3KRW8 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
J3KRW8 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
J3KRW8 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
J3KRW8 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
J3KRW8 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
J3KRW8 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
J3KRW8 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
J3KRW8 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
J3KRW8 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
J3KRW8 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
J3KRW8 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
J3KRW8 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
J3KRW8 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
J3KRW8 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
J3KRW8 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
J3KRW8 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
J3KRW8 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
J3KRW8 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
J3KRW8 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
J3KRW8 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
J3KRW8 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
J3KRW8 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
J3KRW8 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
J3KRW8 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
J3KRW8 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
J3KRW8 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
J3KRW8 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
J3KRW8 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
J3KRW8 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
J3KRW8 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
J3KRW8 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
J3KRW8 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
J3KRW8 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
J3KRW8 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
J3KRW8 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
J3KRW8 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
J3KRW8 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
J3KRW8 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
J3KRW8 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
J3KRW8 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
J3KRW8 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
J3KRW8 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
J3KRW8 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
J3KRW8 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
J3KRW8 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
J3KRW8 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
J3KRW8 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
J3KRW8 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
J3KRW8 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
J3KRW8 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
J3KRW8 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
J3KRW8 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
J3KRW8 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
J3KRW8 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
J3KRW8 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
J3KRW8 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
J3KRW8 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
J3KRW8 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
J3KRW8 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
J3KRW8 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
J3KRW8 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
J3KRW8 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
J3KRW8 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
J3KRW8 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
J3KRW8 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
J3KRW8 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
J3KRW8 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
J3KRW8 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
J3KRW8 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
J3KRW8 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
J3KRW8 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
J3KRW8 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
J3KRW8 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
J3KRW8 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
J3KRW8 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
J3KRW8 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
J3KRW8 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
J3KRW8 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
J3KRW8 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
J3KRW8 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
J3KRW8 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
J3KRW8 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
J3KRW8 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
J3KRW8 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
J3KRW8 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
J3KRW8 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
J3KRW8 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
J3KRW8 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257.1 ms