Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCL28Q9NRJ3 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCL28Q9NRJ3 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CCL28Q9NRJ3 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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