Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
ARHGEF3Q9NR81 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ARHGEF3Q9NR81 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ARHGEF3Q9NR81 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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