Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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PTPROQ16827 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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PTPROQ16827 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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PTPROQ16827 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
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PTPROQ16827 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
PTPROQ16827 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
PTPROQ16827 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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PTPROQ16827 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
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PTPROQ16827 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
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PTPROQ16827 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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PTPROQ16827 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
PTPROQ16827 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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