Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
VAMP3Q15836 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
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VAMP3Q15836 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-2.36□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
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VAMP3Q15836 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
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VAMP3Q15836 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.38□□□□□ -2.79
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VAMP3Q15836 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
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VAMP3Q15836 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-2.4□□□□□ -2.79
VAMP3Q15836 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
VAMP3Q15836 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
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