Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-3.85□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-3.86□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC-3.87□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC-3.88□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-3.89□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-3.9□□□□□ -3.03
HMGN3Q15651 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-3.91□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-3.92□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-3.93□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-3.94□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-3.95□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-3.96□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-3.97□□□□□ -3.04
HMGN3Q15651 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
HMGN3Q15651 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-4.04□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-4.07□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
HMGN3Q15651 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
HMGN3Q15651 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
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