Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PTPRKQ15262 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PTPRKQ15262 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
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PTPRKQ15262 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
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PTPRKQ15262 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
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PTPRKQ15262 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
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PTPRKQ15262 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PTPRKQ15262 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
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