Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-3.55□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-3.55□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-3.56□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-3.56□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-3.57□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-3.58□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-3.59□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-3.6□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-3.61□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SMCO1Q147U7 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-3.72□□□□□ -3
SMCO1Q147U7 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.76□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SMCO1Q147U7 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-3.76□□□□□ -3.01
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